生態(tài)服務：有機農(nóng)業(yè)對自然資源的影響有助于農(nóng)業(yè)生態(tài)系統(tǒng)內(nèi)部的相互作用；這些相互作用對農(nóng)業(yè)生產(chǎn)和自然資源保護都極為重要。產(chǎn)生的生態(tài)服務包括土壤形成和改良、土壤穩(wěn)定、廢物循環(huán)利用、碳截留、養(yǎng)分循環(huán)利用、掠食（害蟲）、授粉和生境。通過選擇有機產(chǎn)品，消費者利用他們的購買力促進了污染較少的農(nóng)業(yè)生產(chǎn)方式，降低了農(nóng)業(yè)在環(huán)境方面隱藏的自然資源退化成本。Jules Pretty最近的出版物: "現(xiàn)代農(nóng)業(yè)的實際成本" 更加詳細地探討了其中許多問題。
答：長期可持續(xù)性：許多環(huán)境變化是長期、緩慢發(fā)生的。有機農(nóng)業(yè)考慮到農(nóng)業(yè)干預行動對農(nóng)業(yè)生態(tài)系統(tǒng)的中長期影響。有機農(nóng)業(yè)既生產(chǎn)糧食，又建立生態(tài)平衡，防止出現(xiàn)土壤肥力問題或蟲害問題。有機農(nóng)業(yè)采取積極的措施，而不是在問題發(fā)生之后才加以處理。
土壤：有機農(nóng)業(yè)的核心是土壤養(yǎng)護方法，如輪作、間作、共生聯(lián)系、覆蓋作物、有機肥料和少耕制。這些方法鼓勵土壤動植物生長，改善土壤形成和結構，建立更加穩(wěn)定的耕作制度。反之又增加了養(yǎng)分和能量循環(huán)，提高了土壤保持養(yǎng)分和保持水的能力，彌補了礦物肥料的空缺。這樣的管理技術在土壤侵蝕控制中也發(fā)揮重要作用：縮短土壤暴露于侵蝕力的時間、增加土壤生物多樣性、減少養(yǎng)分損失、幫助保持和提高土壤生產(chǎn)率。作物吸收的養(yǎng)分通常由農(nóng)場的再生資源彌補，但有時需要用外界的鉀、硫、鈣、鎂和示蹤元素補充有機土壤。

水：在許多農(nóng)區(qū)，地下水受合成肥料和農(nóng)藥污染是一大問題。有機農(nóng)業(yè)禁止使用合成肥料和農(nóng)藥，代之以有機肥料（如堆肥、家畜糞便、綠肥）和利用生物多樣性（栽培的品種和長期植被），改善了土壤結構和水的滲透。管理良好的有機農(nóng)業(yè)保持養(yǎng)分的能力增強，大大減少了地下水被污染的風險。在一些污染嚴重的地區(qū)，政府（如法國和德國政府）大力鼓勵轉向有機農(nóng)業(yè)，認為這是一項恢復措施。

空氣：有機農(nóng)業(yè)通過減少對農(nóng)業(yè)化學品的需求，降低了非再生能源的使用（農(nóng)業(yè)化學品的生產(chǎn)需要大量礦物燃料）。有機農(nóng)業(yè)能夠把碳截留在土壤中，幫助了減輕溫室效應和全球變暖。有機農(nóng)業(yè)使用的許多管理方法（如少耕制、秸桿還田、種植覆蓋作物、輪作、更多地結合種植固氮豆科作物）使更多的碳返回土壤，提高生產(chǎn)率和有助于碳儲存。