要對重要環(huán)境因素有關(guān)的作業(yè)點進(jìn)行審核，（包括顯在的和潛在的重要環(huán)境因素作業(yè)點），在這些作業(yè)點要與負(fù)責(zé)人和操作工人交談，以了解他們是否具備了這些崗位所要求的知識與技能，這些作業(yè)點是否執(zhí)行了環(huán)境管理體系文件中規(guī)定的要求。
    要檢查各種重要的環(huán)境管理記錄。包括：各種主要污染物的監(jiān)測記錄，法律法規(guī)的收集記錄，環(huán)境管理體系內(nèi)審記錄，管理評審記錄，培訓(xùn)記錄等。通過這些記錄判定體系的運行狀況和效果。
現(xiàn)場觀察：審核員要對生產(chǎn)現(xiàn)場、動力設(shè)施現(xiàn)場、環(huán)保設(shè)施現(xiàn)場、危險品及化學(xué)品庫房等進(jìn)行現(xiàn)場檢查，以判斷是否有重要的環(huán)境因素被遺漏，體系文件的實施情況，以及員工的環(huán)境意識等，做到全面了解環(huán)境管理體系在本組織的運行狀況。
　　（3）審核方與受審核方共同評議：分析審核發(fā)現(xiàn)是審核組內(nèi)部對審核中所發(fā)現(xiàn)的問題進(jìn)行分析評審，以找出受審核方在體系上存在的問題。為了更加慎重起見，對于這些審核發(fā)現(xiàn)都要與受審核方的環(huán)境管理人員共同評議一次，以確認(rèn)所有審核發(fā)現(xiàn)的事實依據(jù)。

　　（4）末次會議：審核組長向受審核方宣布審核中發(fā)現(xiàn)的不符合項以及現(xiàn)場審核結(jié)論。

　　編制審核報告階段：審核組在完成現(xiàn)場審核后，要編寫審核報告。審核報告中應(yīng)包括受審核方的基本情況，環(huán)境管理體系文件評審情況，現(xiàn)場審核情況及審核結(jié)論等。如果審核組認(rèn)為受審核方的環(huán)境管理體系符合審核準(zhǔn)則，則推薦注冊。經(jīng)認(rèn)證機(jī)構(gòu)技術(shù)委員會審議后即可批準(zhǔn)注冊。