（1）對于標準中要求建立程序的多數要素，可以編成一體化的程序。例如：4.3.2、4.4.2、4.4.3、4.4.5、4.4.7、4.5.1、4.5.2、4.5.3和 4.5.4等要素。與手冊編寫一樣，在程序中也要注意覆蓋兩個體系的所有要求。
（2）對于4.3.1“環境因素識別和評價”與“危險源辨識，風險評價和風險控制策劃”應該分別編寫二個程序文件，以使其具有較好的可操作性。
（3）對于4.4.6運行控制程序
A) ISO14001環境管理體系中要求，對與所認定的重要環境因素相
關的運行與活動，制定運行控制程序。對一個生產型企業來說，
一般應包括下列運行控制程序。
a. 水污染控制程序
b. 大氣污染控制程序
c. 噪聲控制程序
d. 固體廢棄物管理程序
e. 能源管理程序
f. 原材料管理程序
g. 油品、化學品管理程序
h. 環保設施管理程序
i. 新建、改建、擴建項目環境保護管理程序
j. 供方、承包方管理程序
k. 新產品開發設計管理程序，等。
B) OHSAS18001職業安全健康管理體系在4.4.6運行控制中則要求，對所認定的風險有關的、需要采取控制措施的運行與活動，制定運行控制文件。對一個生產型企業而言，大體包括：
a. 工藝安全管理程序；
b. 設備與設施管理程序；
c. 化學品、油品管理程序；
d. 員工健康管理程序；
e. 女工保護管理程序；
f. 勞動防護用品管理程序；
g. 供方和承包方管理程序；
h. 特殊工種管理程序；
i. 危險作業管理程序；
j. 新、改、擴建工程管理程序；
k. 檢修維護工作管理程序；
l. 電氣安全管理程序；
m. 管網安全管理程序；
n. 廠內交通運輸安全管理程序；
o. 管理或作業變更管理程序等。
從上述兩份典型的運行控制程序目錄可以看出：兩個體系能共用的程序只有3-4個，其余大多數程序所管理的內容不同。所以對二個體系的運行控制程序而言不要勉強合并。要根據二個體系的要求，編制具有可操作性的控制文件。這對于實現重要環境因素與風險的有效控制是必需的。
3、作業指導書（或操作規程）
作業指導書（或操作規程）是指操作崗位所執行的作業文件。對一個具體的崗位而言，文件應盡量統一，最好能實現文件的單一化。對于環境和安全兩方面是如此，甚至包括質量方面的要求都可以變成一份作業指導書，使操作者一目了然。例如：對于一個電子工廠的波峰焊接機操作崗位，在一份作業指導書上可以先寫如何啟動運行設備，保障波峰焊的質量；又可寫明如何避免燙傷等事故；還可寫明如何控制含鉛煙塵的排放和妥善處理含鉛廢物等，一個文件覆蓋三個體系的管理內容。所以對于第三級文件，完全可以實現整合，即對同一崗位整合成為一份單一的文件。