1．必須根據有機(天然)食品的類型、特性、運輸季節、距離以及產品保質貯藏的要求選擇不同的運輸工具。　　2．用來運輸有機(天然)食品的工具(包括車輛、輪船、飛機等)在裝入有機(天然)食品之前必須清洗干凈，必要時進行滅菌消毒，必須用無污染的材料裝運有機(天然)食品。　　3．裝運前必須進行食品質量檢查．在食品、標簽與帳單三者相符合的情況下才能裝運。　　4．裝運過程中所用的工具應清潔衛生，不允許含有化學物品。禁止帶入有污染或潛在污染的化學物品。　　5．運輸包裝必須符合有機(天然)食品的包裝規定，在運輸包裝的兩端，應有明顯的運輸標志，內容包括：始發站、到達站(港)名稱、品名、數量、重量、體積、收(發)貨單位名稱以及有機(天然)食品標志。　　6．不同種類的有機(天然)食品運輸時必須嚴格分開，不允許性質相反和互相串味的食品混裝在一個車(箱)中。　　7．填寫有機(天然)食品運輸單據時，要做到字跡清楚、內容準確、項目齊全。　　8．有機(天然)食品裝車(船、箱)前，應認真檢查車(船、箱)體狀況。對不清潔、不安全，裝過化學品、危險品或者未按合同所規定提供車(船、箱)的必須及時提交運輸部門進行清潔、消毒或調換，符合要求后才能裝入有機(天然)食品．