ISO14000系列環境管理標準與ISO9000系列質量管理標準，都是以優化管理為目的的，都向各類組織提供出標準化的管理模式和實施方案，在體系的設計和構成上都非常類似，而且國家層次上對體系審核、認證的管理工作很相似，由機構認可委員會與人員注冊認可委員會進行統一的協調管理工作。但這兩個標準是從其內涵和施用對象上有較大的不同，主要表現在：
　　　承諾對象不同：ISO9000標準的承諾對象是產品的使用者、消費者；而ISO14000系列標準則是向相關方的承諾，受益者將是全社會、是人類的生存環境和人類自身；它的對象是不確定的，與各個國家和具體地區的人們環境意識和要求相關。

　　　承諾的內容不同：ISO9000系列標準是保證產品的質量；而ISO14000系列標準則要求實施組織承諾遵守法律、法規及其他要求，并對污染預防和持續改進。

　　　體系的構成模式不同：ISO9000的質量管理模式是封閉的；而環境管理體系則是螺旋上升的，開環模式。要求體系每年有所改進和提高。

　　　審核認證的依據不同：ISO9000標準就是質量體系的根本依據：ISO14000系列則必須結合各國的環境法律、法規及相關標準，組織的環境行為不能滿足國家要求的，也難以通過體系的認證。

　　　對審核人員資格的要求不同：對從事ISO9000認證工作人員并沒有特別的專業背景要求，而從事ISO14000認證工作的人員則必須具備相應的環境知識和環境管理經驗，否則難以對現場存在的環境問題做出判斷。