分工細化的組織，一般需要多于三個層次的文件結構，以提供充分的指導；而對于機構設置簡單，部門職責兼顧的組織，則可以只采用兩層次的文件結構（手冊和程序文件），以簡化文件化的體系。在體系策劃中涉及的體系文件組成主要指程序文件的組成。對于已經建立和實施了質量體系的組織，應考慮使質量和環境共用程序文件，如教育和培訓、文件管理、記錄管理、分供方評價、儀器儀表校準和維護、內部審核等。目標和指標、管理評審的內容可以編寫程序文件，也可以在手冊中提供一定的操作性而省去程序文件。文件組成的策劃中最重要的是運行控制和應急準備與響應程序文件的組成與組織原有的現場管理存在缺陷的方面。應急準備與響應程序文件的組成與組織的性質密切相關，存在著比較多的發生意外事故和緊急情況隱患的組織，應針對不同的情況分別制定程序，以健全相應管理制度，避免該程序文件篇幅過長。總之，環境管理體系的策劃涉及內容較多，還有諸如確定可行的認證范圍、制定體系建立和推進計劃等方面的工作。每一個咨詢師在工作中都有自己的一套方式方法，應該說體系策劃沒有最好，只有更好。