（二）發證檢驗。檢驗機構收到企業的樣品后，應當檢查樣品是否符合規定，包裝、封條是否完好。對符合規定的樣品進行檢驗。不符合規定的樣品，檢驗機構不予受理，并通知受理申請的質量技術監督部門處理。
    檢驗機構應當依據相應的標準對樣品進行檢驗，應當于收到樣品之日起15個工作日內完成檢驗任務，出具檢驗報告一式4份（國家質檢總局、受理申請的質量技術監督部門、生產企業各1份，檢驗機構存檔1份）。
    檢驗機構應當確保產品檢驗的各項工作（如樣品的處理、保管、檢驗、判定和檢驗報告的編制、審核、批準、發送等）符合要求，并對檢驗報告負責。
    （三）發證檢驗判定。發證檢驗應當按照國家標準、行業標準進行判定，沒有國家標準和行業標準的，可以按照地方標準進行判定，特殊情況下可以按照企業明示執行的標準判定。按照企業標準進行判定的，應當對企業標準的合理性進行審查。
    檢驗項目全部符合規定的，判為符合發證條件；檢驗項目中有1項或者1項以上不符合規定的，判為不符合發證條件。
    （四）出廠檢驗設備。生產企業應當具備《審查細則》中規定的必備的出廠檢驗設備。如果企業使用其它的檢驗儀器也可以完成《審查細則》中規定的出廠檢驗項目，并能夠證明其檢驗結果與標準規定具有良好的一致性和相關性，也可以視為企業具備了相應的出廠檢驗能力。
    （五）委托出廠檢驗。不具備產品出廠檢驗能力的企業，或部分出廠檢驗項目尚不能自檢的企業，應當委托國家質檢總局統一公布的檢驗機構，按生產批逐批進行出廠檢驗。企業應當與檢驗機構簽訂書面委托合同，合同中要規定如何組成生產批、依據標準和方法、檢驗完成時限、檢驗項目及收費、合同期限等。企業生產批的組成，由生產企業和檢驗機構根據實際情況確定（《審查細則》另有規定的除外）。審查組在現場審查時，應當對生產批組批的合理性和合同期限進行審查，對明顯不合理的，應當要求予以調整。承擔委托出廠檢驗的檢驗機構對委托方不履行合同或者合同期間中止的，應當及時書面報告質量技術監督部門。
    （六）加嚴檢驗。質量技術監督部門對出現嚴重質量問題的食品，或者在監督抽查、定期監督檢查、年審、換證復查中發現達不到規定要求的食品，應當進行加嚴檢驗，并書面通知該企業。質量技術監督部門指定具備發證檢驗或者定期監督檢驗資格的質檢機構，在30日內3次隨機抽取該企業的產品，對不合格項目（需要時加關聯項目）進行檢驗。3次檢驗均合格后不再進行加嚴檢驗。如有不合格繼續進行，直至連續3次檢驗合格為止。