第二、有機農(nóng)業(yè)就是傳統(tǒng)農(nóng)業(yè)，發(fā)展有機農(nóng)業(yè)是在走回頭路。這一點是絕大多數(shù)人初次接觸有機農(nóng)業(yè)概念時最易產(chǎn)生的誤解，也是首先必須澄清的事實。有機農(nóng)業(yè)是由一些科學家、哲學家為了保護我們賴以生存的土壤，生產(chǎn)健康的作物和食品的背景下提出來的，在世界經(jīng)歷了“石油農(nóng)業(yè)”帶來的能源、環(huán)境和儀器安全危機之后得以大力提倡和發(fā)展并超越現(xiàn)代農(nóng)業(yè)思想的一種農(nóng)業(yè)生產(chǎn)模式。它只有在生物學、生態(tài)學發(fā)展到一定程度，在人們認識到人與自然的關系只有協(xié)調(diào)起來才能促進人類進步與發(fā)展之后才可能得到認同和推廣。因此可以說有機農(nóng)業(yè)是人們在高度發(fā)達的科學技術基礎上重新審視人與自然關系的結果，而不是復古和倒退。有機農(nóng)業(yè)拒絕使用農(nóng)用化學品，但決不是拒絕科學，相反它是建立在應用現(xiàn)代生物學、生態(tài)學知識，應用現(xiàn)代農(nóng)業(yè)機械，作物品種，現(xiàn)代良好的農(nóng)業(yè)生產(chǎn)管理方法和水土保持技術，以及良好的有機廢棄物和作物秸桿和處理技術，生物防治技術和實踐。人們聽到作物生產(chǎn)力不用農(nóng)藥、化肥就覺得不可思議，正是現(xiàn)代農(nóng)業(yè)過分依賴化學和工業(yè)技術，忽略了環(huán)境和生態(tài)的體現(xiàn)。   
  第三、有機方法種植的作物產(chǎn)量肯定比現(xiàn)代種植的產(chǎn)量低。應該承認，在有機農(nóng)業(yè)生產(chǎn)體系建立期間（有機轉換期間），有機作物的產(chǎn)量通常會比常規(guī)作物的產(chǎn)量低。但從長遠來看，一旦建立良性的有機農(nóng)業(yè)生產(chǎn)體系，有機生產(chǎn)的作物產(chǎn)量并不一定會比常規(guī)作物產(chǎn)量低，整個有機體系的生產(chǎn)力一定高于常規(guī)體系的生產(chǎn)力。而且產(chǎn)量高低也是一相對的概念，通過超過系統(tǒng)可承受的外部物資的投入來獲得過高的產(chǎn)量并不是有機農(nóng)業(yè)追求的目標。    
 第四、有機農(nóng)業(yè)和作物品質(zhì)低、營養(yǎng)差。現(xiàn)在人們通常認為，由于在有機農(nóng)業(yè)生產(chǎn)中不允許使用化學肥料，作物在生長中營養(yǎng)元素供應不夠，因此作物長勢肯定不好，產(chǎn)品質(zhì)量肯定差。有機農(nóng)業(yè)強調(diào)種植業(yè)的平衡，以及有機生產(chǎn)體系內(nèi)養(yǎng)分的循環(huán)和補充，通過有機生產(chǎn)措施培肥土壤肥力，建立待續(xù)的作物營養(yǎng)物質(zhì)供應體系。因此一旦有機農(nóng)業(yè)生產(chǎn)體系建成，并形成良性循環(huán)，作物在生長中可以從系統(tǒng)中獲得充分的完全營養(yǎng)，而常規(guī)作物生產(chǎn)通常僅重視少數(shù)幾種營養(yǎng)元素的供應，一些作物生長的必需營養(yǎng)物質(zhì)難以得到補充，導致產(chǎn)品的口味和營養(yǎng)不好，因此有機種植的作物品質(zhì)不會比常規(guī)的作物差，相反有機生產(chǎn)的產(chǎn)品其口感好、味道正是人們的普遍常識。    
  第五、有機食品一定是無污染，不含化學殘留物質(zhì)。食品是否有污染物質(zhì)是一個相對的概念。自然界中不存在絕對不含任何污染物質(zhì)的食品。隨著高精密分析儀器的檢測限的提高，自然界中即使再優(yōu)質(zhì)的食品，也或多或少地含有一些污染物質(zhì)應該說，有機食品中污染物質(zhì)的含量比普通食品低。但有機食品并不是絕對無污染。強調(diào)有機食品的無污染特性，僅會導致人們過份重視對環(huán)境和終產(chǎn)品的污染狀況的分析，而忽視對整個生產(chǎn)過程的全程質(zhì)量控制。