初次洽談后，申請認證企業應向認證機構索取申請認證用的申請表和協議書或合同書。
（2）正式提出申請，簽訂合同或協議
    企業在作出質量體系認證工作總體安排和提出整改工作要求后，就可向認證機構提出質量體系認證的正式申請，遞交申請表。當認證機構接受申請委托后，企業即可與認證機構簽訂合同或協議。
    有的認證機構要求在提出正式申請交申請表的同時，應提交企業的質量保證手冊或其它有關文件，例如認證體系復蓋產品的介紹、企業營業執照等。此時，正式申請則應在質量手冊編好后再提出，在送申請表的同時送交質量保證手冊，然后簽訂合同或協議。
4．送審質量保證手冊
    企業申請質量體系認證，必須要經過認證機構的兩次審核，第一次是對企業的質量保證手冊的審查，審查手冊內容是否達到所選用質量保證標準的要求，是否能滿足企業保證產品質量的需要，這是對企業質量保證體系適宜性的審查；第二次審查是對企業現場進行檢查，檢查實際質量活動是否有程序文件，是否符合質量保證手冊和程序文件的規定，現場檢查是對企業質保體系實施性的檢查。
    由于質量保證手冊審查是體系認證審核的第一關，因而申請體系認證的企業，對手冊的編寫應引起足夠的重視，使編寫的質保手冊能符合要求，爭取審查一次通過。送審的質保手冊應是經企業最高管理者批準的受控版本。
    認證機構對質保手冊審查后會正式提出書面的審核意見，企業對所提意見應進行研究分析，對不符合所選用質量保證標準內容要求的意見，必須依據所提意見對質保手冊進行修訂；對屬于建議性的意見（認證機構一般不提這類意見），企業則應根據本企業實際情況決定是否對手冊進行修訂。根據審查意見修訂質保手冊時，應按規定程序辦理修訂手續。除應向認證機構提供修訂后質保手冊換回原提供的手冊外，對企業內所發手冊的受控版本，都應進行修訂。修訂后的質保手冊即是認證機構對現場檢查的依據。
5．作好現場檢查迎檢的準備工作
（1）資料準備
    作好現場檢查迎檢的準備，不但關系到認證能否一次通過，同時也關系到現場檢查能否順利進行。為此，企業質量管理部門應編制印發“迎接認證現場檢查準備資料清單”提出各部門應準備資料的目錄，經審查后交各部門進行準備。質管部門對各部門準備好的資料應進行抽查，以保證準備好的資料能符合要求。對各部門準備資料應提出以下要求：
a）為作到有備無患，準備的資料應寬一些；
b）資料準備應按每項體系要素準備，準備好的資料應按不同的體系要素分別存放；
c）每個要素的資料應分為提供和備用，凡與認證所選質量保證標準或質保手冊直接有關的，均為提供的資料，凡間接有關的為備用資料；